F.E.A.R.の設定関連のファイルは「Config.exe」「Default.archcfg」などがあり、そのうち簡単に編集できるのはConfig.cfgである。これはメモ帳で編集することができる。そこにある値を書き換えたり、新しい行を追加することによってゲームの設定を変更できる。また\Program Files\Sierra\FEAR ディレクトリにある「Config.exe」を使うと、いくつかの設定変更をゲームを起動させずに簡単に行うことができる。
\Program Files\Sierra\FEAR ディレクトリにある「Config.exe」を起動させて、「Options」タブを選び「Disable movies」にチェックを入れる。もしくはユーザーディレクトリの最後に"DisableMovies" "1"という行を足す。一番最初にでるロゴは飛ばせないが、2番目に出るムービーを飛ばすことができ、ゲーム起動が若干早くなる。
\Documents and Settings\All Users\(Shared) Documents\Monolith Productions\FEAR にある「Setting.cfg」にある"ScreenWidth"と"ScreenHeight"の値を書き換えることで、ゲーム中には設定できない解像度（1280*1024）に変更することができる。ただしその状態でゲーム中の「Display」オプションを選んでしまうと、デフォルトの解像度に戻されてしまうので注意。
LG社製のドライブを使っていると認識しにくいらしいく、発売元から修正パッチが出ている。DVD自体は認識するけどメニューが出ないという場合は、DVDを直接開いてSetup.exeを実行すればいい。また何度かDVDを読み直すと認識する場合もある。
特定のマップを読み込むときに出るエラー。人によって症状の出るマップが違うらしく、多分マップファイルが壊れているのだろうが再インストールすれば直る。その他私の場合、人数が余っているのにゲームに入れない、ゲームプレイ中に落ちやすくなるという症状が出たが、これらも再インストールで解決した。